La manière la plus courante d'être infecté par le virus Zika est par l'intermédiaire des moustiques suceurs de sang, en particulier les espèces aedes aegypti et aedes albopictus. Ces moustiques se nourrissent de jour comme de nuit et préfèrent les climats tropicaux et subtropicaux, les mêmes qui transmettent des maladies telles que la dengue et le
chikungunya. Il se transmet lorsqu'un moustique déjà infecté par le virus se nourrit d'une personne infectée, devenant ainsi infecté par le virus et transmettant le virus à la personne suivante qu'il pique. Ce cycle permet au virus de persister au sein de vastes populations de moustiques, en particulier lorsque les mesures mises en place pour stopper la propagation des moustiques sont insuffisantes ou inexistantes.
Outre la transmission vectorielle par les moustiques, il existe d'autres voies de transmission du Zika, notamment les rapports sexuels vaginaux, anaux et oraux. Ce mode de transmission met l'accent sur les pratiques de protection, en particulier lorsque l'un des partenaires a été en contact avec le virus. Le Zika a également été trouvé dans la salive et l'urine, bien qu'ils ne soient pas considérés comme le principal mode de transmission. Il s'est parfois propagé par transfusion sanguine, mais grâce à des tests réguliers, la propagation du virus est contrôlée.
Une autre voie critique est la transmission verticale, lorsqu'une femme infectée transmet l'agent pathogène à son enfant à naître et souffre de troubles congénitaux tels que la microcéphalie. Ces différents modes de transmission montrent à quel point l'absence de mesures préventives efficaces empêchant non seulement le contact avec les moustiques, mais aussi le contact direct, peut aider à vaincre cette maladie.